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英伟达详解BioNeMo推理运行时BioIR
英伟达公布BioNeMo推理运行时BioIR，这是一个在纯PyTorch环境下加速生物分子结构预测模型的Python库。在8张H100的匹配基准测试中，加速后的Boltz-2折叠吞吐量达每GPU小时58.5K残基，较torch编译开源实现提升2.90倍。BioIR已支持AlphaFold数据库扩展…
MarkTechPost52 天前
#生物计算
共 5 篇相关资讯，按重要度与时间排序，每 3 小时更新。
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研究人员用 AI 设计可切割其他蛋白质的蛋白质
研究人员利用 AI 技术设计出能够切割其他蛋白质的新型蛋白质，展示了 AI 在蛋白质工程领域的精准设计能力。该成果有望推动靶向蛋白质降解、疾病治疗和生物工具开发等应用，是 AI 辅助生物设计的又一进展。
Hacker News – AI17 天前
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亚马逊发布抗体设计AI研究新论文
Amazon Bio Discovery发布三篇新论文，针对AI驱动抗体工程中的瓶颈问题，涵盖结合预测器基准测试和从头设计的实验验证。这推进了AI在生物学和药物发现领域的应用。
Amazon Science Blog41 天前
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TorchCraft：反转全原子结构预测器实现统一结合体设计
研究提出TorchCraft，通过冻结的全原子结构预测器优化序列logits，统一支持微型结合体、VHH、环肽与配体结合蛋白设计。基于AlphaFold 3预训练权重，生成的微型结合体与VHH在四个靶点上经实验验证具有结合能力，无需事后序列重设计。该框架将预测器反转扩展到多种结合体形式与分子场景。
arXiv cs.AI44 天前
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RiboBridge 框架发布：蛋白质条件 RNA 结合体从头设计
研究者提出 RiboBridge，一种结构优先的框架，将 RNA 构象生成与蛋白质-RNA 组装分离。该方法先在蛋白表面提出候选结合界面，在预训练 RNA 结构潜空间生成构象，再预测相互作用约束完成刚性放置。在 124 个蛋白-RNA 复合物基准上，其 fNAT 与 DockQ 最高、界面与配体 …
arXiv cs.LG9 天前