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RiboBridge 框架发布：蛋白质条件 RNA 结合体从头设计
研究者提出 RiboBridge，一种结构优先的框架，将 RNA 构象生成与蛋白质-RNA 组装分离。该方法先在蛋白表面提出候选结合界面，在预训练 RNA 结构潜空间生成构象，再预测相互作用约束完成刚性放置。在 124 个蛋白-RNA 复合物基准上，其 fNAT 与 DockQ 最高、界面与配体 …
arXiv cs.LG10 天前
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研究者提出 RiboBridge，一种结构优先的框架，将 RNA 构象生成与蛋白质-RNA 组装分离。该方法先在蛋白表面提出候选结合界面，在预训练 RNA 结构潜空间生成构象，再预测相互作用约束完成刚性放置。在 124 个蛋白-RNA 复合物基准上，其 fNAT 与 DockQ 最高、界面与配体 …
研究提出 GOLD 方法，将离散 RNA 序列与连续侧链角度通过 GeoVAE 映射到统一潜流形进行协同扩散，并引入免训练、梯度引导的采样机制以提升结构有效性。在序列恢复率、二级结构有效性和三维可折叠性指标上均达到最优。