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研究质疑质谱到分子检索的可分离性不等于可对齐性
arXiv 论文在 MassSpecGym 上审计「分别预训练谱图与分子编码器再对齐」的路线。作者证明部分预测目标能固定分子身份却不固定对齐所需度量，候选式目标还会奖励与谱图无关的先验。结论是模拟谱图比冻结几何更有效地缓解配对数据稀缺。
arXiv cs.LG3 天前
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arXiv 论文在 MassSpecGym 上审计「分别预训练谱图与分子编码器再对齐」的路线。作者证明部分预测目标能固定分子身份却不固定对齐所需度量，候选式目标还会奖励与谱图无关的先验。结论是模拟谱图比冻结几何更有效地缓解配对数据稀缺。
论文指出分子机器学习用于评估分布外性能的结构不相交划分规则在库规模扩大后失效。在 227,690 个分子的公开库上，单链接聚类在 MCES 距离阈值 10 下导致图渗流，单一连通分量占 95.5%，测试集被限制在 4.5%。作者提出优化判据，将 2.6×10^10 分子对缩减至 1.15×10^7…