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arXiv 论文提出 PH-GNN：用持续同调实现跨物种离子通道分类
该 arXiv 论文指出，蛋白质分类器在随机划分训练集和测试集时会产生系统发育泄漏，导致模型高估其在分布外数据上的表现，这在按离子通道靶点分类毒液化合物时尤为明显。作者将跨物种预测建模为结构化分布偏移，融合 ESM-2 序列嵌入与图注意力网络，并系统比较五种结构归纳偏置。在留一分类群评估下，持续同…
arXiv cs.LG10 天前
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该 arXiv 论文指出，蛋白质分类器在随机划分训练集和测试集时会产生系统发育泄漏，导致模型高估其在分布外数据上的表现，这在按离子通道靶点分类毒液化合物时尤为明显。作者将跨物种预测建模为结构化分布偏移，融合 ESM-2 序列嵌入与图注意力网络，并系统比较五种结构归纳偏置。在留一分类群评估下，持续同…
研究提出将持续同调融入 DMAE 骨干的拓扑感知表示学习框架，显式编码全局结构连通性，并采用持续同调引导的掩码策略与辅助解码器。在两个 TPMS 数据集上，家族分类最高提升 3.9%，无监督属性聚类最高提升 26.7% 与 51.5%，回归 R² 达 0.993。结果表明持续拓扑是三维力学超材料表…