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稀缺数据下多任务ProtBERT识别无序蛋白
论文提出MT-ProtBERT，面向低数据场景的ProtBERT多任务扩展，整合动态窗口掩码、多尺度一维卷积分类器与生化先验辅助目标。在磷酸化位点预测与蛋白紧致度预测两个小数据集任务上，MT-ProtBERT全面超越基于RNN的IDP专用模型PARROT。结果表明自监督与生化任务结合可提升数据稀缺…
arXiv cs.LG40 天前
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论文提出MT-ProtBERT，面向低数据场景的ProtBERT多任务扩展，整合动态窗口掩码、多尺度一维卷积分类器与生化先验辅助目标。在磷酸化位点预测与蛋白紧致度预测两个小数据集任务上，MT-ProtBERT全面超越基于RNN的IDP专用模型PARROT。结果表明自监督与生化任务结合可提升数据稀缺…