PIDiff 联合离散与 SE(3) 扩散设计蛋白质界面
原文标题：Joint Discrete and SE(3) Diffusion for Protein Interface Design
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论文提出 PIDiff，将离散序列空间扩散与连续 SE(3) 结构流形扩散耦合，用于靶标条件化的蛋白质序列与结构共设计。配套 PIFormer 架构与 PIBench 数据集，在 minibinder 与抗体设计任务上优于基线。
- 问题
- 现有蛋白质生成方法难以同时满足结合界面的几何与理化互补性。
- 方法
- 耦合离散序列扩散与 SE(3) 结构流形扩散，配合 PIFormer 交错几何不变点注意力与序列自注意力。
- 结果
- 在 minibinder 与抗体设计任务上，序列成功率、结合能、序列-结构共设计性均优于基线。
- 影响
- 为靶标条件化 binder 设计提供统一序列-结构生成路径，加速治疗性蛋白早期设计。
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