#基因组基础模型

IsoAlign：用 JEPA 实现异构体感知的 DNA-蛋白对齐

论文提出 IsoAlign，一个将基因组预训练锚定在异构体感知 DNA-蛋白对齐上的多模态框架，弥补现有自监督预训练忽略可变剪接的缺陷。它包含从 DNA 预测蛋白表征的 DP-JEPA 与建模同基因异构体关系的 IM-JEPA。在致病性、适应度、基因表达与转录因子结合等任务上显著提升下游表现。