蛋白质类增量学习基准:视觉CIL方法难以迁移
原文标题:Do Vision CIL Methods Transfer to Protein? A Diagnostic Benchmark of Frozen Protein Encoders
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该论文对九种代表性类增量学习(CIL)方法在五种蛋白质编码器(序列、结构及序列-结构)和两个酶功能数据集上进行了受控基准测试,编码器保持冻结。结果显示没有方法能可靠跨编码器迁移,失败源于梯度稳定性信号弱、嵌入几何异质性大以及协方差假设容量不匹配。作者认为表示本身应被视为持续学习设计的核心组件,而非被动的特征提取器。
- 问题
- 视觉类增量学习方法在冻结蛋白质表示上能否可靠迁移,此前缺乏系统评测。
- 方法
- 冻结五种蛋白质编码器,在酶功能数据集上受控对比九种CIL方法,并做梯度、嵌入几何与协方差诊断。
- 结果
- 无方法能跨编码器可靠迁移,失败在多种阶段构造下持续存在。
- 影响
- 做蛋白质功能预测的团队不能直接套用视觉CIL方案,需按编码器几何定制持续学习策略。
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