MIRCID:推断枢纽miRNA提升药物机制建模
原文标题:MIRCID: Inferred Hub-miRNAs Drive Cross-Task Improvements in Drug Mechanistic Modeling
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研究提出MIRCID框架,通过HubmiRNet从L1000标志基因推断414个泛癌枢纽miRNA,在通路分类与药物机制检索任务中优于转录因子活性特征。结果表明推断miRNA可作为转录组数据的生物学重编码,提升扰动药物建模的跨任务表现。
- 问题
- 药物机制建模依赖扰动转录组,但常缺配对的miRNA测量数据。
- 方法
- 用HubmiRNet从977个L1000标志基因推断414个泛癌枢纽miRNA,与TF活性特征对比。
- 结果
- 推断Pearson相关达87.72%;全miRNA任务71.21%对SiCmiR的67.30%。
- 影响
- 为扰动药物建模提供可复用的转录组重编码特征,无需实测miRNA即可增强跨任务表现。
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