PairFuse 将预训练全原子表示泛化到统一结合体设计
原文标题:Towards Generalizing Pretrained All-Atom Representations to Unified Binder Design
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arXiv 论文提出参数高效方法 PairFuse,通过轻量逐层适配器把预训练全原子表示融入独立预训练的几何隐扩散模型。适配器一方面丰富分子块特征,一方面把成对结构信息注入去噪器,作者从理论上证明其保持几何并增强注意力表达力。在抗体、多肽与小分子结合体设计基准上均优于原扩散模型与既有融合基线。
- 问题
- 全原子表示仅用于单一模态结合体设计,未泛化到统一设计。
- 方法
- 用轻量逐层适配器把预训练全原子表示融入几何隐扩散模型,融合特征与成对结构信息。
- 结果
- 在抗体、多肽、小分子结合体设计基准上优于原扩散模型与融合基线。
- 影响
- 参数高效地把已有全原子模型复用到统一结合体设计,降低多模态生物设计的训练成本。
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