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arXiv 提出 PIFT：将肽-靶点相互作用迁移至小分子生成
论文提出 PIFT 框架，通过掩码离散扩散与连续流匹配的联合采样引导，将已知肽-靶点相互作用模式迁移到靶向蛋白-蛋白相互作用的小分子生成。实验显示该方法提升界面恢复能力，获得较强对接性能与良好分子性质。
arXiv cs.LG5 小时前
#分子生成
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BSIT 采样器提升稀疏奖励下推理时搜索效率
论文指出基于树的采样器因依赖类 DDPM 转移而耦合父子状态，探索不足，难以应对稀疏奖励搜索。作者提出 Bootstrap Stochastic Interpolant Tree（BSIT）采样器，解耦子节点生成与父节点依赖，扩大采样自由度以增强路径空间多样性。在稀有物种发现与目标分子生成等任务上…
arXiv cs.LG13 天前
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arXiv 论文：PairIT 自回归 Transformer 低数据分子优化
论文提出 PairIT，一种基于 SMILES 序列的自回归 Transformer 训练框架，通过学习结构相似分子对实现种子分子生成与多属性优化。在 MoleculeNet 与 TDC 数据集上，仅 68M 参数的标准模型即可在低数据场景下实现稳健的分子优化。
arXiv cs.LG18 天前