新调度法加速 SE(3) 等变结构预测
原文标题：Refined Topology-Pass Scheduling: Damped Trust-Region Compensation for Dynamic k-NN Graphs in SE(3)-Equivariant Structure Prediction
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arXiv 论文针对等变结构预测中动态 kNN 图重建开销，提出两遍拓扑调度设计，将图构建基选择形式化为阻尼不动点迭代。方法给出非翻转证书、最小方差重放增益与信赖域投影，C++ 实现实现 1.5 倍首遍与 1.76 倍每轮加速且无精度损失，代码已开源。
- 问题
- 等变结构预测中每步重建动态 kNN 图开销大，冻结图又留下拓扑误差。
- 方法
- 提出两遍拓扑调度，将图构建基选择形式化为阻尼不动点迭代，并给出非翻转证书、最小方差重放增益与信赖域投影。
- 结果
- C++ 实现首遍加速 1.5 倍、每轮加速 1.76 倍且无精度损失；L2 精确复现 PB 边集（D=0.0000）。
- 影响
- 在不牺牲精度的前提下显著加速等变结构预测训练，可直接用于分子/蛋白结构建模流水线。
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